工程合同纠纷的主要问题有哪些？

答案：1、施工合同的效力问题；2、合同无效是否应进行结算；3、备案合同和“补充协议”即黑白合同不一致，在结算时应采纳哪一份合同作为结算的依据问题；4、对于建设部推荐施工合同版本通用条款中涉及的发包方逾期不结算是否视为认可送审价的问题；5、工程款结算采取何种标准的问题；6、诉讼中，造价司法鉴定(司法审价)的范围；7、关于工程质量、工期、农民工利益等问题。